Originaire de la Charente, Christophe Jallet découvre le football dans le petit club de l'AL Saint-Brice. Repéré à quinze ans par Niort, il effectue ses premiers pas en professionnel avec les Chamois lors de la saison 2003-2004. A l'été 2006, il s'engage avec le FC Lorient, où il gagne rapidement sa place de titulaire. 103 matches plus tard, sa régularité et son activité côté droit lui permettent de signer au Paris-Saint-Germain et devenir par la suite international lors de la saison 2012-2013. Peu utilisé lors de sa cinquième saison dans le club de la capitale, il rejoint l'Olympique Lyonnais à l'été 2014 afin de gagner du temps de jeu. Un pari réussi puisqu'il participe à 42 rencontres avec l'OL lors de l'exercice 2014-2015, et 34 l'année suivante, où il partage le poste d'arrière droit avec Rafaël. Lors de la saison 2016-2017, il ne commence pas tout de suite la saison en raison d'une blessure, puis continuera à se partager le poste avec Rafael.